Вам необходимо подать в суд иск о взыскании со страховой компании страхового возмещения в размере, установленно Вашим независимым оценщиком.

Согласно п. 48 постановлению Пленума ВС РФ от 29.01.2015 N 2 "О применении судами законодательства об обязательном страховании гражданской ответственности владельцев транспортных средств":

При заключении соглашения об урегулировании страхового случая без проведения независимой технической экспертизы транспортного средства или независимой экспертизы (оценки) поврежденного имущества потерпевший и страховщик договариваются о размере, порядке и сроках подлежащего выплате потерпевшему страхового возмещения. После осуществления страховщиком оговоренной страховой выплаты его обязанность считается исполненной в полном объеме и надлежащим образом, что прекращает соответствующее обязательство страховщика (пункт 1 статьи 408 ГК РФ).

Заключение со страховщиком соглашения об урегулировании страхового случая без проведения независимой технической экспертизы транспортного средства или независимой экспертизы (оценки) поврежденного имущества является реализацией права потерпевшего на получение страхового возмещения, вследствие чего после исполнения страховщиком обязательства по страховой выплате в размере, согласованном сторонами, основания для взыскания каких-либо дополнительных убытков отсутствуют. Вместе с тем при наличии оснований для признания указанного соглашения недействительным потерпевший вправе обратиться в суд с иском об оспаривании такого соглашения и о взыскании суммы страхового возмещения.

Несмотря на то, что Пленум допускает оспаривание такого соглашения, судебная практика, к сожалению, не на Вашей стороне.

Посмотрите на сайтах судов решения по делам:

Апелляционное определение Ставропольского краевого суда от 16.12.2015 по делу N 33-8749/2015

Или, например, Ваш Нижегородский суд

Апелляционное определение Нижегородского областного суда от 01.09.2015 N 33-8797/2015